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## 'FS_traitements_bdatdiff.Rmd'
L’objectif de ce travail est d’analyser les différences l’évolution des teneurs en carbone organique enregistrée à l’échelle du canton. Ces résultats ont été fournis par InfoSol et résultent d’un ré-échantillonnage des analyses de la bdat communale réalisée 100 fois. Au cours de ces répétitions, les teneurs en CO sont comparées pour 2 périodes données et un test statistique est réalisé pour connaître la significacité des différences à l’échelle du canton. Pour une description de la méthode utilisée, le lecteur intéressé peut consulter les articles suivants :
Les résultats sont analysés à l’échelle de la France et à l’échelle de plusieurs strates géographiques selon le plan suivant :
Dans cette section, les évolutions des teneurs en CO à l’échelle nationale sont présentées sous forme d’état des lieux général.
La figure ci-dessous présente pour toutes les périodes comparées, la proportion du type d’évolution des teneurs en CO par canton. Sur toutes les périodes comparées, la proportion de canton ayant une évolution significative des teneurs en CO (augmentation ou diminution) est inférieure à 30%. Dans cette part, il y a quasiment autant de canton enregistrant une augmentation qu’une diminution des teneurs (2191 et table(melted.bdatdiff[,"diff_corgox"])[[2]] respectivement). Une large part des cantons (plus de 70%) n’a donc pas enregistrés d’évolution significative des teneurs en CO.
La figure 2 présente un histogramme du nombre de canton ayant connu une augmentation ou une diminution significative des teneurs en carbone organique. L’histogramme est appliqué sur toutes les périodes et stratifié par zones d’élevage et par type de climat.
La figure prĂ©sente les mĂªmes proportion gĂ©nĂ©rales observĂ©e Ă l’échelle nationale prĂ©cĂ©demment. La part de canton aux Ă©volutions des teneurs en CO non significative est toujours très importante. Globalement, le nombre de canton ayant eu une augmentation ou une diminution de la teneur en CO est Ă©quilibrĂ© Ă l’échelle des strates gĂ©ographiques. Quelques zones se distinguent toutefois :
Dans la figure 3, les histogrammes sont analysés par périodes comparées et classés par l’évolution du pourcentage de surfaces fourragères principales (SFP) entre 1988 et 2010. La figure montre des différences importantes entre les périodes analysées :
Ces résultats confirment les observations présentées précédemment à l’échelle nationale faisant état d’une diminution puis d’une augmentation des teneurs en CO.
En conclusion de cette section, on constate plusieurs points : - Les Ă©volutions des teneurs en CO entre les diffĂ©rentes pĂ©riodes ne suivent pas les mĂªmes tendances. Les premières observation vues dans FS_traitements_bdat.Rmd se confirment. Les teneurs en CO ont augmentĂ© sur la pĂ©riode [2010-2014] et cette augmentation est particulièrement prononcĂ©e entre les pĂ©riodes [2000-2004]-[2010-2014]. - La diminution des teneurs est surtout observĂ©e entre [1990-1994]-[2000-2004] et [1994-1999]-[2005-2009] et [1990-1994]-[2005-2009]. - Les principales pĂ©riodes oĂ¹ l’évolution des teneurs en CO est marquante seront analysĂ©es dans le dĂ©tails et sont les suivantes : * Diminution : (13) [1990-1994]-[2000-2004] et (23) [1994-1999]-[2000-2004] * Augmentation : (35) [2000-2004]-[2010-2014] et (45) [2005-2009]-[2010-2014] - Les principales zones d’élevage affectĂ©es par ces changements sont : A, B1, C1, C2 et D. Ce rĂ©sultat provient surtout de la densitĂ© d’analyse dans ces zones et de leur Ă©tendue spatiale.
De la figure ci-dessus, les 10 principales régions touchées par des évolutions significatives sont présentées dans le tableau ci-dessous.
| Â | diff | nom_region | period | freq |
|---|---|---|---|---|
| 107 | Diminution | NORD-PAS-DE-CALAIS | 13 | 96 |
| 22 | Augmentation | CENTRE | 35 | 57 |
| 114 | Diminution | PICARDIE | 13 | 48 |
| 87 | Diminution | BRETAGNE | 45 | 43 |
| 60 | Augmentation | PICARDIE | 35 | 40 |
| 117 | Diminution | POITOU-CHARENTES | 13 | 40 |
| 27 | Augmentation | CHAMPAGNE-ARDENNE | 45 | 39 |
| 84 | Diminution | BRETAGNE | 13 | 37 |
| 26 | Augmentation | CHAMPAGNE-ARDENNE | 35 | 36 |
| 56 | Augmentation | PAYS DE LA LOIRE | 35 | 34 |
La région Centre et les pays de la Loire ont une fréquence importante de canton ayant une augmentation de C. Le Nord-pas-de-Calais, la Bretagne, la Picardie et la région Poitou-Charentes sont les principales régions touchées par des diminutions en C.
On retrouve ces observations sur les cartes d’évolution des teneurs. Dans le détail, c’est le morbihan qui est surtout affecté par des chutes de teneurs en carbone organique et en région Centre, on observe une augmentation des teneurs en CO concentrée dans le Perche. Ces résultats très ciblés font penser à un effet de bord (différences liés aux laboratoires?), surtout pour les régions Picardie, Nord-Pas-De-Calais et le département du Morbihan. La suite des analyses se concentrera sur ces zones.
La figure ci-dessous présente la relation entre la teneur initiale en CO et la différence pour les 4 périodes de comparaisons identifiées.
Figure Ă commenter
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## Using Period as id variables
## Using Period as id variables
## Using Period as id variables
## Using Period as id variables
A faire, rajouter les strates et les régions voir département dans la modélisation nationale de l’évolution des teneurs en CO.AFAIRE AFAIRE
## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (stat_boxplot).
A tester rapidement
| Evolution_teneurs | Type_variable | R2_nonajusté |
|---|---|---|
| diffmedian_corgox13 | Anthropique | 0.1554 |
| diffmedian_corgox13 | Naturelle | 0.09887 |
| diffmedian_corgox13 | Complet | 0.2266 |
| diffmedian_corgox23 | Anthropique | 0.1375 |
| diffmedian_corgox23 | Naturelle | 0.05956 |
| diffmedian_corgox23 | Complet | 0.1546 |
| diffmedian_corgox35 | Anthropique | 0.1331 |
| diffmedian_corgox35 | Naturelle | 0.12 |
| diffmedian_corgox35 | Complet | 0.1733 |
| diffmedian_corgox45 | Anthropique | 0.2362 |
| diffmedian_corgox45 | Naturelle | 0.1259 |
| diffmedian_corgox45 | Complet | 0.254 |
| diffmedian_corgox13 | diffmedian_corgox23 | diffmedian_corgox35 |
|---|---|---|
| 12.77 | 9.51 | 5.33 |
| diffmedian_corgox45 |
|---|
| 12.81 |
| strates | Period | mod | value |
|---|---|---|---|
| A | 14 | r2 | 0.0626 |
| B1 | 14 | r2 | 0.1327 |
| B2 | 14 | r2 | 0.04793 |
| C1 | 14 | r2 | 0.138 |
| C2 | 14 | r2 | NA |
| D | 14 | r2 | NA |
| E1 | 14 | r2 | 0.02786 |
| E2 | 14 | r2 | NA |
| G1 | 14 | r2 | NA |
| G2 | 14 | r2 | NA |
| A | 14 | MSE | 502.7 |
| B1 | 14 | MSE | 239.1 |
| B2 | 14 | MSE | 2025722 |
| C1 | 14 | MSE | 301.9 |
| C2 | 14 | MSE | NA |
| D | 14 | MSE | NA |
| E1 | 14 | MSE | 14729083 |
| E2 | 14 | MSE | NA |
| G1 | 14 | MSE | NA |
| G2 | 14 | MSE | NA |
| A | 14 | RMSE | 21.99 |
| B1 | 14 | RMSE | 15.42 |
| B2 | 14 | RMSE | 349.4 |
| C1 | 14 | RMSE | 17.26 |
| C2 | 14 | RMSE | NA |
| D | 14 | RMSE | NA |
| E1 | 14 | RMSE | 717.3 |
| E2 | 14 | RMSE | NA |
| G1 | 14 | RMSE | NA |
| G2 | 14 | RMSE | NA |
| A | 24 | r2 | 0.03611 |
| B1 | 24 | r2 | 0.03722 |
| B2 | 24 | r2 | 0.03788 |
| C1 | 24 | r2 | 0.2054 |
| C2 | 24 | r2 | NA |
| D | 24 | r2 | NA |
| E1 | 24 | r2 | 0.04238 |
| E2 | 24 | r2 | NA |
| G1 | 24 | r2 | NA |
| G2 | 24 | r2 | NA |
| A | 24 | MSE | 519.3 |
| B1 | 24 | MSE | 167 |
| B2 | 24 | MSE | 292126 |
| C1 | 24 | MSE | 247.2 |
| C2 | 24 | MSE | NA |
| D | 24 | MSE | NA |
| E1 | 24 | MSE | 630238 |
| E2 | 24 | MSE | NA |
| G1 | 24 | MSE | NA |
| G2 | 24 | MSE | NA |
| A | 24 | RMSE | 22.34 |
| B1 | 24 | RMSE | 12.87 |
| B2 | 24 | RMSE | 259.5 |
| C1 | 24 | RMSE | 15.62 |
| C2 | 24 | RMSE | NA |
| D | 24 | RMSE | NA |
| E1 | 24 | RMSE | 345.2 |
| E2 | 24 | RMSE | NA |
| G1 | 24 | RMSE | NA |
| G2 | 24 | RMSE | NA |
| A | 15 | r2 | 0.04927 |
| B1 | 15 | r2 | 0.2659 |
| B2 | 15 | r2 | 0.03896 |
| C1 | 15 | r2 | 0.105 |
| C2 | 15 | r2 | NA |
| D | 15 | r2 | NA |
| E1 | 15 | r2 | 0.03721 |
| E2 | 15 | r2 | NA |
| G1 | 15 | r2 | NA |
| G2 | 15 | r2 | NA |
| A | 15 | MSE | 479.3 |
| B1 | 15 | MSE | 241 |
| B2 | 15 | MSE | 389005 |
| C1 | 15 | MSE | 201.5 |
| C2 | 15 | MSE | NA |
| D | 15 | MSE | NA |
| E1 | 15 | MSE | 8229821 |
| E2 | 15 | MSE | NA |
| G1 | 15 | MSE | NA |
| G2 | 15 | MSE | NA |
| A | 15 | RMSE | 21.46 |
| B1 | 15 | RMSE | 15.46 |
| B2 | 15 | RMSE | 269.9 |
| C1 | 15 | RMSE | 14.11 |
| C2 | 15 | RMSE | NA |
| D | 15 | RMSE | NA |
| E1 | 15 | RMSE | 785.4 |
| E2 | 15 | RMSE | NA |
| G1 | 15 | RMSE | NA |
| G2 | 15 | RMSE | NA |
| A | 25 | r2 | 0.06255 |
| B1 | 25 | r2 | 0.04312 |
| B2 | 25 | r2 | 0.05306 |
| C1 | 25 | r2 | 0.01539 |
| C2 | 25 | r2 | NA |
| D | 25 | r2 | NA |
| E1 | 25 | r2 | 0.04303 |
| E2 | 25 | r2 | NA |
| G1 | 25 | r2 | NA |
| G2 | 25 | r2 | NA |
| A | 25 | MSE | 400.9 |
| B1 | 25 | MSE | 371.9 |
| B2 | 25 | MSE | 885896 |
| C1 | 25 | MSE | 151.6 |
| C2 | 25 | MSE | NA |
| D | 25 | MSE | NA |
| E1 | 25 | MSE | 17578397 |
| E2 | 25 | MSE | NA |
| G1 | 25 | MSE | NA |
| G2 | 25 | MSE | NA |
| A | 25 | RMSE | 19.56 |
| B1 | 25 | RMSE | 19.21 |
| B2 | 25 | RMSE | 316.2 |
| C1 | 25 | RMSE | 12.24 |
| C2 | 25 | RMSE | NA |
| D | 25 | RMSE | NA |
| E1 | 25 | RMSE | 935.7 |
| E2 | 25 | RMSE | NA |
| G1 | 25 | RMSE | NA |
| G2 | 25 | RMSE | NA |
| A | 13 | r2 | 0.04189 |
| B1 | 13 | r2 | 0.08621 |
| B2 | 13 | r2 | 0.04005 |
| C1 | 13 | r2 | 0.06434 |
| C2 | 13 | r2 | NA |
| D | 13 | r2 | NA |
| E1 | 13 | r2 | 0.02944 |
| E2 | 13 | r2 | NA |
| G1 | 13 | r2 | NA |
| G2 | 13 | r2 | NA |
| A | 13 | MSE | 400.2 |
| B1 | 13 | MSE | 221.3 |
| B2 | 13 | MSE | 2551949 |
| C1 | 13 | MSE | 123.5 |
| C2 | 13 | MSE | NA |
| D | 13 | MSE | NA |
| E1 | 13 | MSE | 5799412 |
| E2 | 13 | MSE | NA |
| G1 | 13 | MSE | NA |
| G2 | 13 | MSE | NA |
| A | 13 | RMSE | 19.7 |
| B1 | 13 | RMSE | 14.82 |
| B2 | 13 | RMSE | 346.5 |
| C1 | 13 | RMSE | 11.06 |
| C2 | 13 | RMSE | NA |
| D | 13 | RMSE | NA |
| E1 | 13 | RMSE | 625.4 |
| E2 | 13 | RMSE | NA |
| G1 | 13 | RMSE | NA |
| G2 | 13 | RMSE | NA |
| A | 35 | r2 | 0.04526 |
| B1 | 35 | r2 | 0.0344 |
| B2 | 35 | r2 | 0.05244 |
| C1 | 35 | r2 | 0.1063 |
| C2 | 35 | r2 | NA |
| D | 35 | r2 | NA |
| E1 | 35 | r2 | 0.03817 |
| E2 | 35 | r2 | NA |
| G1 | 35 | r2 | NA |
| G2 | 35 | r2 | NA |
| A | 35 | MSE | 283.6 |
| B1 | 35 | MSE | 466.8 |
| B2 | 35 | MSE | 2864832 |
| C1 | 35 | MSE | 150.8 |
| C2 | 35 | MSE | NA |
| D | 35 | MSE | NA |
| E1 | 35 | MSE | 5490031 |
| E2 | 35 | MSE | NA |
| G1 | 35 | MSE | NA |
| G2 | 35 | MSE | NA |
| A | 35 | RMSE | 16.59 |
| B1 | 35 | RMSE | 21.49 |
| B2 | 35 | RMSE | 381.8 |
| C1 | 35 | RMSE | 12.23 |
| C2 | 35 | RMSE | NA |
| D | 35 | RMSE | NA |
| E1 | 35 | RMSE | 526.7 |
| E2 | 35 | RMSE | NA |
| G1 | 35 | RMSE | NA |
| G2 | 35 | RMSE | NA |
| strates | Period | mod | value |
|---|---|---|---|
| 3 | 14 | r2 | 0.07248 |
| 4 | 14 | r2 | 0.09599 |
| 5 | 14 | r2 | 0.1657 |
| 3 | 14 | MSE | 265 |
| 4 | 14 | MSE | 477.2 |
| 5 | 14 | MSE | 380.8 |
| 3 | 14 | RMSE | 16.22 |
| 4 | 14 | RMSE | 21.74 |
| 5 | 14 | RMSE | 19.28 |
| 3 | 24 | r2 | 0.02951 |
| 4 | 24 | r2 | 0.1755 |
| 5 | 24 | r2 | 0.1093 |
| 3 | 24 | MSE | 223.9 |
| 4 | 24 | MSE | 271.4 |
| 5 | 24 | MSE | 265.1 |
| 3 | 24 | RMSE | 14.92 |
| 4 | 24 | RMSE | 16.41 |
| 5 | 24 | RMSE | 16.19 |
| 3 | 15 | r2 | 0.09257 |
| 4 | 15 | r2 | 0.1579 |
| 5 | 15 | r2 | 0.0921 |
| 3 | 15 | MSE | 299.4 |
| 4 | 15 | MSE | 263.1 |
| 5 | 15 | MSE | 365.1 |
| 3 | 15 | RMSE | 17.24 |
| 4 | 15 | RMSE | 16.13 |
| 5 | 15 | RMSE | 18.91 |
| 3 | 25 | r2 | 0.07941 |
| 4 | 25 | r2 | 0.1924 |
| 5 | 25 | r2 | 0.02434 |
| 3 | 25 | MSE | 269.7 |
| 4 | 25 | MSE | 125.6 |
| 5 | 25 | MSE | 195.5 |
| 3 | 25 | RMSE | 16.35 |
| 4 | 25 | RMSE | 11.17 |
| 5 | 25 | RMSE | 13.87 |
| 3 | 13 | r2 | 0.03885 |
| 4 | 13 | r2 | 0.02988 |
| 5 | 13 | r2 | 0.061 |
| 3 | 13 | MSE | 263.1 |
| 4 | 13 | MSE | 221.2 |
| 5 | 13 | MSE | 283.7 |
| 3 | 13 | RMSE | 16.16 |
| 4 | 13 | RMSE | 14.82 |
| 5 | 13 | RMSE | 16.63 |
| 3 | 35 | r2 | 0.01325 |
| 4 | 35 | r2 | 0.2093 |
| 5 | 35 | r2 | 0.03393 |
| 3 | 35 | MSE | 285.8 |
| 4 | 35 | MSE | 156.4 |
| 5 | 35 | MSE | 177.8 |
| 3 | 35 | RMSE | 16.82 |
| 4 | 35 | RMSE | 12.45 |
| 5 | 35 | RMSE | 13.23 |